Suivant le décret 2009-729 du 3 août 2009 portant fonctionnement du CNERS, la composition du CNERS est la suivante :
- Le Directeur chargé de la recherche en santé
- Deux représentants du ministre chargé de la santé
- Un juriste représentant la faculté de droit
- Un représentant de l’Institut des droits de l’homme et de la paix
- un enseignant spécialisé en médecine légale
- un enseignant spécialisé dans la pharmacologie
- Un représentant de chaque ordre de profession
- Un spécialiste en santé publique, expert en épidémiologie
- Une personnalité appartenant à une institution de recherche en santé
- Un expert en sciences sociales
- Un représentant de l’Académie des Sciences et Techniques
- Un représentant du barreau
- Un représentant des professions paramédicales
- Un représentant de la confession musulmane
- Un représentant de la confession chrétienne
- Un représentant de la société civile
- Cinq personnalités désignées ès qualités par le ministre chargé de la Santé
- Un représentant de la Direction de la Pharmacie et du Médicament